Kantor Kementerian Agama Kabupaten Bengkulu Selatan berdiri pada tahun 1968 yang kala itu dipimpin oleh Abdullah Amin. Kedudukan Kantor Kementerian Agama Bengkulu Selatan sempat 3 kali berganti tempat, yang pertama  bertempat di Kelurahan Ibul, kemudian pindah ke Jln.Uprt.Ghalib Kelurahan Belakang Gedung dengan menyewa 2 buah rumah) dan pada akhirnya menempati bangunan kantor yang sekarang bertempat di Jln.Pangeran Duayu pada tahun 1981 pada masa kepemimpinan Drs.H.Saleh Hadi Susanto hingga sekarang.