Kantor Kementerian Agama Kabupaten Bengkulu Selatan berdiri pada tahun 1968 yang kala itu dipimpin oleh Abdullah Amin. Kedudukan Kantor Kementerian Agama Bengkulu Selatan sempat 3 kali berganti tempat, yang pertama bertempat di Kelurahan Ibul, kemudian pindah ke Jln.Uprt.Ghalib Kelurahan Belakang Gedung dengan menyewa 2 buah rumah) dan pada akhirnya menempati bangunan kantor yang sekarang bertempat di Jln.Pangeran Duayu pada tahun 1981 pada masa kepemimpinan Drs.H.Saleh Hadi Susanto hingga sekarang.
Dalam melaksanakan tugas sebagaimana dimaksud dalam Pasal 7 PMA Nomor 19 Tahun 2019, kantor Kementerian Agama kabupaten/kota menyelenggarakan fungsi:
perumusan dan penetapan visi, misi, dan kebijakan teknis di bidang pelayanan dan bimbingan kehidupan beragama kepada masyarakat di kabupaten/kota;
pelayanan, bimbingan, dan pembinaan kehidupan beragama;
pelayanan, bimbingan, dan pembinaan haji dan umrah, serta zakat dan wakaf;
pelayanan, bimbingan, dan pembinaan di bidang pendidikan madrasah, pendidikan agama, dan pendidikan keagamaan;
pembinaan kerukunan umat beragama;
pelaksanaan kebijakan teknis di bidang pengelolaan administrasi dan informasi;
pengoordinasian perencanaan, pengendalian, pengawasan, dan evaluasi program; dan
pelaksanaan hubungan dengan pemerintah daerah, instansi terkait, dan lembaga masyarakat dalam rangka pelaksanaan tugas Kementerian Agama di kabupaten/kota.
